顺应潮流:大部分血浆ctDNA-MRD检测的应用前景!

2022-02-14 15:23:31 来源:
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"磷酸化时被不属于MRD扫描的潜质是就其的,想这些进展将此后减少未来不会MRD扫描的精确开放性。"

白血病的MRD扫描是一种锐利且特异的用于风险分析白血病高血压血液中所源开放性遗传物质(如ctDNA)相比数量的作法。在这种精神状态下,高血压难以肉眼可见的鳞状,但确实发挥作用国际标准流行病精研影像作法难以扫描到但之后不会造成白血病复发的纤小鳞状。

MRD,常称做纤小渗入鳞状(Minimal Residual Disease)。转用“Minimal” (纤小)这个字词,是因为它在文献资料和流行病精研领域专家中所更常用。不过,“Minimal”这个字词确实带有“误导开放性”,因为低总体的炎症在几率和肌肉注射对政府层面也确实带有重要本质。“Measurable”(可观测)一字词可更精确地描述渗入在病人体内的免疫细胞的发挥作用。NCCN须知同时转用了“Minimal Residual Disease”(纤小渗入鳞状)和“Measurable Residual Disease”(可观测渗入鳞状)两个术语。

此外,可行开放性精研术研究表明在分子不会总体上扫描多种白血病子类的ctDNA某种程度带有流行病精研诱因,文献资料和流行病精研领域专家有时也不会转用“Molecular Residual Disease”(分子不会渗入鳞状)一字词。

近年来,国内外在并不一定中所基于ctDNA的MRD分析(ctDNA-MRD)的流行病精研原始数据和确凿证据越来越多,开启了并不一定瘤MRD扫描的风潮。并不一定瘤ctDNA-MRD扫描的技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(追问统计分析)

对原发许多组织开展DNA以鉴定高血压的特异DNA变异图谱,然后结构设计程序不会独创panel或转用一般来说panel开展个开放性化时的ctDNA扫描统计分析。

2)Tumor-uninformed assays(置之不理统计分析)

也可以称做Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即不必原发许多组织,至少依赖于两组预先选定程序不会/电子束结构设计的与白血病子类之外的一般来说panel开展ctDNA扫描统计分析,恰巧扫描ctDNA等位遗传物质的同时,辅以ctDNA磷酸化时或影片组精研等多组精研作法。太少了许多组织样本不足或风险分析位点不足或TAT过长等难题。

Tumor-informed assays的技术策略更相一致社不会上的认知,在应有高特异开放性的从必要条件下,可通过风险分析多位点的sample-level(样本总体)进一步减少其阈值,技术如此一来相比来说不是都有高。Tumor-uninformed assays的技术策略更典型早先用,通过减少site-level(位点总体)扫描阈值并辅以ctDNA磷酸化时或影片组精研并在手合机器精研习迭代进一步减少其阈值和特异开放性,技术如此一来相比来说高。

2021年4月末29日,《Clinical Cancer Research》Skype撰写了“至少转用肝脏ctDNA扫描在手直肠癌高血压纤小渗入鳞状(MRD)”的书评,首次发布新闻了Guardant Reveal的精研术研究原始数据:MRD扫描阈值多超过91%,特异开放性多达100%,这些辨认成支持了至少肝脏ctDNA-MRD扫描(Tumor-uninformed assays)的潜在流行病精研广泛应用。

2021年8月末13日,《Clinical Cancer Research》Skype撰写了“顺应潮流:至少肝脏ctDNA-MRD扫描的广泛应用从期望”的书评,在这那时候精研术学术界们探讨分析了至少肝脏ctDNA扫描MRD的能力,以及将磷酸化时统合到ctDNA扫描的潜在好处。2

Parikh及其熟人1 和Taieb及其熟人3 探讨了至少肝脏ctDNA-MRD扫描在在手直肠癌(CRC)高血压中所的潜在流行病精研广泛应用。

▲ ctDNA磷酸化时和等位遗传物质在两项精研术研究中所的广泛应用比较(Parikh和Taieb)

在手直肠癌(CRC)的肌肉注射即使如此面临着一个挑战,即为数众多的CRC高血压因最初疾病复发而过早遇害。尽管流行病精研转用了国际标准的都有结构设计肌肉注射,但高风险IIIC期CRC高血压的5年几率也至少有53%,究其原因是难以辨认成影像精研上未扫描到的纤小渗入鳞状(MRD)。4

目从前,仍迫切无需精确相符哪些高血压术后发挥作用MRD,以努力导师减少或增加都有结构设计肌肉注射,并增加痊愈的确实开放性,同时借以地减少不必要肌肉注射的之外毒开放性。

在过往的几年那时候,我们对ctDNA在CRC诊断和几率中所的广泛应用有了广泛的了解。目从前,基于ctDNA的MRD分析正广泛广泛应用白血病的肌肉注射中所。

ctDNA是由DNA的短影片分成(差不多130-150bp),由免疫细胞通过细胞遇害、肺部或新陈代谢释放到体液中所。 ctDNA的半衰期较宽导致其带入敏感的即时负重多种子类,它的发挥作用确实反映了影像精研上看不见的纤转移。

在痊愈开放性肌肉注射在手束后,ctDNA中所成现的染色质等位遗传物质对随后的影像精研复发带有高的阴开放性预测经济效益,都有是当这些等位遗传物质与切掉的许多组织中所的等位遗传物质相一致时。扫描这种ctDNA判别的MRD可以在I-III期CRC中所提从前影像精研数月末预测复发,从而为两组之后不会复发的CRC高血压最主要一个分析新的疗法的后台。然而,这些ctDNA经济制度等位遗传物质判别的MRD扫描作法的阈值即使如此是局限的,迫切无需小型化其扫描精确开放性。

ctDNA的磷酸化时扫描比不上ctDNA的经济制度等位遗传物质扫描。ctDNA的磷酸化时异恰巧CRC中所非常常见于,并被视为大多数癌变的最初前期。这种磷酸化时,就其判别为DNA中所腺嘌呤的C5位置添加氨基基团,调节附近遗传物质的表多达,最主要经典作品的抑癌遗传物质失活。与经济制度等位遗传物质相比,CRC中所发挥作用更多的磷酸化时间歇性周边地区,为减少MRD扫描的阈值最主要了机不会。SEPT9,就是第一个利用血液扫描单遗传物质磷酸化时间歇性开展前列腺癌和最初扫描CRC的作法。尽管ctDNA磷酸化时有这些优点,但这些相同的特开放性也无需谨慎,以始终保持扫描统计分析的特异开放性,并尽量减少骗阴开放性的确实开放性。

在这种历史背景下,Parikh和Taieb的更进一步最新的精研术研究在手果为我们对ctDNA精确开放性的理解最主要了有用的补充,即不必原发许多组织,至少通过血液ctDNA磷酸化时或为首ctDNA等位遗传物质即可开展精确的MRD分析。与其他无需对原发许多组织开展DNA以导师近期ctDNA统计分析的扫描不同,更进一步精研术研究探讨了Tumor-uninformed assays的有效开放性,它有几个竞争者,最主要更快的TAT,增高初始开销,对许多组织不足或不必无需的高血压开展风险分析。

Parikh等人最主要了一种ctDNA磷酸化时在手合ctDNA经济制度等位遗传物质的一般来说panel开展MRD的统计分析分析(NGS作法),与其他零售业上必无需的MRD扫描作法相比,这种作法不无需切掉的许多组织以及独创化时。在之后肌肉注射后转用时,这种至少肝脏ctDNA-MRD扫描对复发带有流行病精研本质的特异开放性(100%)和阈值(55.6%),通过统合微小DNA特质和纵向风险分析统计分析,其阈值可进一步减少至91%。1 该作法被用于正在开展的从前瞻开放性精研术研究,最主要导师IIA期在手肠癌肌肉注射对政府的NRG共同开发组精研术研究(NCT04068103)。虽然还无需额外的原始数据集来正确性这些辨认成,但这些在手果事实证明了基于ctDNA的MRD扫描在置之不理的情况下可遵从的扫描精确开放性特质。

Taieb等人的精研术研究利用了一对先从前被事实证明是CRC切掉后几率之外的磷酸化时遗传物质标记物WIF1和NPY(ddPCR作法),并将它们广泛应用PRODIGE-GERCOR IDEA-France次测试,将III期CRC高血压随机包含3个月末 vs 6个月末的都有结构设计化时疗。在对参加III期次测试的III期CRC高血压开展的首次ctDNA-MRD分析中所,有13.8%的高血压术后为ctDNA-MRD阴开放性,并被确认为独立的几率多种子类。3 同时,精研术学术界也指成,与其他转用NGS作法的ctDNA-MRD精研术研究相比,本精研术研究中所ctDNA的阴开放性率较低。阈值和PPV某种程度低于NGS扫描在手果,ctDNA-MRD阴开放性和阴开放性的5年DFS分作65%和73%,尽管都有结构设计肌肉注射的和不期望的从前统计分析样本处理确实不会对这些在手果产生影响。该作法或多或少的是其相比简单,非常低的开销和潜在的再现开放性,不无需零售业扫描中所所见的专利申请扫描作法。正在开展的从前瞻开放性精研术研究将进一步分析至少肝脏ctDNA扫描是否能够精确分析MRD,以便对CRC高血压开展风险分层,并导师都有结构设计肌肉注射对政府。

无论转用何种作法,至少用肝脏ctDNA-MRD扫描来导师CRC高血压的肌肉注射决定,无需精确且精确的扫描作法。无需进一步减少至少肝脏ctDNA-MRD扫描的阈值来相符哪些高血压可以从肌肉注射降级中所获益,以避免不恰当地选择高危高血压遵从较低强度的肌肉注射。Parikh及其熟人的精研术研究在手果表明,统合DNA和微小DNA以及纵向肝脏风险分析,可显著减少至少肝脏ctDNA-MRD的阈值。相比之下,ctDNA-MRD扫描的高特异开放性对于ctDNA作为一个完备的生物多种子类来相符肌肉注射升级是至关重要的。由于特异开放性不足,骗阴开放性的ctDNA-MRD确实不会使高血压遵从不必要的强化时肌肉注射。Parikh及其熟人的精研术研究在手果事实证明,除经济制度等位遗传物质外,还可以通过在手合微小DNA磷酸化时特质的统计分析来始终保持特异开放性。Taieb等人的统计分析作法的竞争者在于减少了流行病精研特质的阈值和几率,但是,正如精研术学术界宣称的那样,单独的两个遗传物质磷酸化时标记确实难以最主要与在手合经济制度等位遗传物质作法的精确开放性特质。重要的是,这项工作也忽略了国际标准化时统计分析从前必要条件的重要开放性,因为各种提取作法可以在很大程度上影响ctDNA的得率和完备开放性。在未来不会的精研术研究中所,这些统计分析从前的考虑将显得越来越重要。

磷酸化时被不属于MRD扫描的潜质是就其的,想这些进展将此后减少未来不会MRD扫描的精确开放性。总之,至少肝脏ctDNA-MRD的扫描最主要了一个独具的机不会,转用一种无创作法来探索肌肉注射计划,并这样一来扫除高危高血压的纤转移开放性鳞状。这些精研术研究在手果无疑为未来不会ctDNA-MRD导师的从前瞻开放性流行病精研次测试铺平了高架道路。

MRD,即使如此是一个更快的发展的广泛应用,我们预计近两年确实不会成现新的的确凿证据,要么在手果显示成MRD扫描的流行病精研诱因的上都,要么在手果显示成MRD扫描的其他竞争者和新的用途。

参考:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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